def PhyDMSPrepAlignmentParser():
parser = ArgumentParserNoArgHelp(formatter_class=ArgumentDefaultsRawDescriptionFormatter,<EOL>description='<STR_LIT:\n>'.join([<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>"<STR_LIT>",<EOL>phydmslib.__acknowledgments__,<EOL>'<STR_LIT>'.format(phydmslib.__version__),<EOL>'<STR_LIT>'.format(phydmslib.__url__),<EOL>]))<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', type=ExistingFile, help="<STR_LIT>")<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', help="<STR_LIT>")<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', help="<STR_LIT>")<EOL>parser.set_defaults(prealigned=False)<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', action='<STR_LIT:store_true>', dest='<STR_LIT>', help="<STR_LIT>")<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', help="<STR_LIT>", default='<STR_LIT>')<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', type=FloatBetweenZeroAndOne, help="<STR_LIT>", default=<NUM_LIT>)<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', type=IntGreaterThanZero, default=<NUM_LIT:2>, help="<STR_LIT>")<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', nargs='<STR_LIT:*>', help="<STR_LIT>")<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', nargs='<STR_LIT:*>', help="<STR_LIT>")<EOL>parser.add_argument('<STR_LIT>', '<STR_LIT>', action='<STR_LIT:version>', version='<STR_LIT>'.format(version=phydmslib.__version__))<EOL>return parser<EOL>
Returns *argparse.ArgumentParser* for ``phydms_prepalignment``.